​Le Ministère est structuré en 10 sous-ministériats et un Secrétariat répartis dans 13 régions. De plus, 3 organismes lui sont rattachés :

• la Société des traversiers du Québec;
• la Société de l’assurance automobile du Québec;
• la Commission des transports du Québec.

Cette section fournit d’autres informations sur l'organisation du Ministère, dont ses actions à l’égard des personnes handicapées, la composition de son budget, son organigramme et sa répartition territoriale.